于都县位于赣江源流的贡水中游。贡水（古时湖水、汉水，合为龙舌咀，总名湖汉，在邑东十里。绕城而西至麻油坑，复西南行，委蛇曲屈，至大滩七十里，为邑治下流大江。贡水今称贡江，西流赣州八境台，这一段谓之贡江。后与章江汇合为赣江，直流鄱阳湖汇入长江。）是流经县境的主要干流，汇集梅江、澄江、濂江、小溪河等4条较大支流。贡水干流和4条较大支流又汇集48条流域面积20平方公里以上的小支流。境内河流属赣江水系，总长度1283公里，其中贡水在境内的长度为66公里；河网密度每平方公里为0.44公里。区划成贡水、梅江、濂水等3个流域。西汉建县以来，雩山山脉，贡水河川，沉淀了于都深厚的历史文化神韵。

     贡水，古称湖水。发源于石城县石寮岽（海拔1390米），流经瑞金、会昌。在会昌县城以上又称绵江，是贡水的上游。在会昌县城汇合湘水后始称贡水。北西流经庄口有濂水汇合，进入县境黄麟朱田至梓山花桥为一长峡谷，俗称白鹅峡谷，水流湍急，主要险滩有老虎脑和白鹅滩。澄江汇入后，两岸有冲积地段，开始进入于都盆地，至龙舌咀有梅江汇入，折向西流经于都县城，此段为贡水中游。过县城至中埠两岸冲积平原互相交错，小溪河于白田汇入。过三门滩贡水又进入峡谷地带，俗称十里河排，水深流急，经峡山大河滩向赣县县境。江口以下，河道开阔，水流变缓，在赣州市注入赣江，此段为贡水下游。

   贡水流域面积27074平方公里，其中282平方公里来自广东和福建。流域形状近似倾斜的菱形，东西狭，南北长；东南高，西北低。主河长度255公里，平均河床坡降千分之0.463，自会昌至赣州市河长183公里，县境内66公里。全河落差309米，自会昌至赣州市66米，县境内25.6米。

贡水在县境内汇集流域面积500平方公里的主要一级支流有梅江、澄江、濂水、小溪河。汇集流域面积50—500平方公里的一般一级支流有固院河、楂林河。汇集流域面积20—50平方公里的一级小支流有于阳河、里泗河、河坪河、步前河、罗坳河、苏坑河、罗江河、正坑河（于阳河流经会昌大陂河至庄口于右岸注入贡水，属二级支流）。支流众多，水量充沛，据峡山水文站1953—1989年实测，多年平均年径流量134.24亿立方米，多年平均年流量408.5立方米每秒。

贡水自白鹅峡至澄江口河宽100—250米，砂石质河床，两岸有狭长的冲积地带。澄江口以下进入于都盆地后，两岸地表风化甚烈，冲浸日剧，沙质河床且浅宽，一般河宽200—400米，土质河岸易崩塌，县城对岸水南坝1949—1989年崩塌近50米。梅江汇入夹带泥沙尤多，峡山水文站1959—1989年实测，多年平均每立方米水样含沙量0.24公斤，年输沙量336万吨，1973年最多达591万吨。以致河床淤积日增，1980年实测，县城西侧贡水河床比1950年抬高1.6米，汛期沿岸易受洪涝灾害。建国以后，贡水已初步治理。